透過技術授權及策略聯盟等方式，高端疫苗已與數家國際研究機構合作，加速潛力開發標的的全球上市。
WHO
World Health Organization
世界衛生組織（WHO）是聯合國專門機構之一，為世界最大的政府間公共衛生組織，致力於傳染病防治。針對新冠肺炎嚴峻疫情，WHO啟動全球團結疫苗試驗，目的在於快速評估前景可期的新冠疫苗。高端新冠肺炎疫苗為首批入選的兩項疫苗之一，這項試驗將在哥倫比亞、馬利及菲律賓三個國家，超過40個臨床試驗中心執行，規模預計超過4萬人。
NIH
National Institutes of Health
美國國家衛生研究院（NIH），是全球規模最大的醫學研究機構，旗下研究人員超過2萬人。其商業化能力優異，已成功開發並對外授權多個年銷售額超過10億美元的暢銷藥物。目前高端疫苗已從NIH技轉引入新冠肺炎疫苗及登革熱疫苗開發案。
US CDC
Centers for Disease Control and Prevention
美國疾病控制與預防中心（US CDC）隸屬於美國衛福部，是全球傳染性疾病控制與公共衛生資源整合的重要單位。除了在全球疾病監控上扮演重要角色外，US CDC也是新興傳染性疾病防治的重要研發單位。針對登革熱的疫苗開發，高端疫苗公司已與US CDC展開合作，利用類病毒顆粒技術（VLP）平台發展新世代登革熱疫苗。
UCAB
Utrecht Centre for Affordable Biotherapeutics for Public Health
UCAB是由荷蘭烏特勒支大學（Utrecht University）與世界衛生組織（WHO）共同成立的非營利醫藥研發機構，旨在開發高品質且價格可負擔的生物藥品。在WHO的支持下，由UCAB進行統籌，減少重複研發的資源浪費，使各個合作夥伴可以及時又具成本效益的方式生產生物相似藥，並確保產品品質符合國際標準。目前高端疫苗已是UCAB聯盟的一員，與其他三家國際藥廠共同開發抗呼吸道融合病毒的生物相似藥。
國家衛生研究院
National Health Research Institutes
國家衛生研究院（NHRI）是台灣國家級醫學研究中心，旨在發展醫藥科技，增進國人健康。國衛院主要研究標的包含前瞻醫學、藥物發現、公共衛生及傳染病防治等，並在竹南設有疫苗先導工廠，進行疫苗產品的早期開發。在新型流感及腸病毒領域上，高端疫苗與國衛院有多項技術移轉與共同研發合作。